公共基础学院前身为公共课程部，于2016年12月更名为公共基础学院。学院承担全校公共课程教学任务和工科专业建设任务。现有制药工程、食品质量与安全、物联网工程三个工科专业和生物与医药、制药工程两个硕士点。学院下设外文、计算机、物联网、化学、分析检验、药物合成、食品安全、制药工程、数理9个教研室，1个工程实验中心，1个应用化学研究所。现有教职工113人，其中专任教师95人，实验教师11人，专职辅导员5人，工勤1人。教师中博士35人，硕士52人；教授12人，副教授27人，高级实验师4人。讲师50人，实验师5人。特聘教授2人。在校学生989人，其中本科生943人，研究生46人。

近年来，公共基础学院秉承“笃学精业，修德厚生”的校训，在学校党政的正确领导下，致力于工科人才培养和公共课程教学两项基本职能，不断加强课程建设和学科建设，落实人才培养中心地位。

公共基础课程部分，主要承担我校《大学英语》、《大学语文》、《大学计算机基础》、《医用物理学》、《高等数学》、《医用化学》、《基础化学》、《无机化学》、《有机化学》、《分析化学》、《仪器分析》、《物理化学》、《医药数理统计》等必修课，以及《应用文写作》等限选课和《<红楼梦>知识讲评》、《现当代文学赏析》、《外国文学赏析》、《环境化学与人类健康》、《现代科学技术与医学》等选修课，为我校的人才培养提供自然科学和人文社会科学基本理论、基础知识和基本技能，培养学生的职业素养与人文情怀，提升学生的综合素质。

同时，为适应国家和社会用人需求，学院依托现有学科资源，结合我校医学学科优势，努力开拓，求实创新，以医学为背景开设了制药工程、食品质量与安全和物联网工程三个工科专业，并分别于2013年、2015年和2016年招生。秉承开门办学理念，与蚌埠市食品药品监督管理局、安徽丰原集团有限公司等单位深度合作，充分发挥社会优势资源对教育、教学和工程实践的支撑作用。选派优秀青年教师作为科技特派员下企业，帮助企业解决生产中的技术难题，提升了教师自身的专业知识和工程实践技能。近五年来，本科生获批70余项国家级、省级大学生创新创业训练计划项目，多次在国家级、省级比赛中崭露头角。2022届毕业生升学率达17.29%，就业率达91.12%，社会及用人单位满意度良好。2022年，制药工程本科专业获批省级一流专业。

在办好工科专业基础上，学院不断加强硕士点建设和学科建设工作。分别于2019和2020年获批制药工程、生物与医药两个硕士点。2022年，生物与医药硕士点分别获批省级特色学位点建设项目、省级研究生联合培养基地建设项目，省级硕士后工作站。生物与医药学科获批省级高峰培育学科。

学院坚持教学第一，科研并重，创新发展的工作理念，不断锤炼教师教学基本功，提高教师科研能力和整体素质，打造了一批教学水平过硬、科研能力突出的师资队伍。教师多次在国家级、省级教学比赛中获奖。同时，积极申报各级各类教科研课题，加强多学科的交叉融合。近五年来，立项国家级项目1项，省厅级以上教科研课题111项，发表包括Science在内的高水平论文68篇。